纳米孔测序前沿信息_纳米孔测序技术原理(2024年12月实时热点)
牛津纳米孔测序技术详解:从原理到应用 牛津纳米孔测序技术是一种革命性的DNA测序方法,它利用纳米孔技术来读取DNA序列。以下是关于这项技术的详细介绍: 电阻膜与DNA测序 ONT牛津纳米孔测序技术的核心是电阻膜,通过测量DNA分子在纳米孔中通过时引起的电流变化来推断DNA序列。这种方法适用于各种类型的DNA测序,包括全长cDNA测序、直接RNA测序以及基于连接反应的测序流程。 文库构建流程 ONT文库构建流程包括PCR-CDNA建库测序和直接RNA测序。PCR-CDNA建库测序适用于全长转录本和RNA修饰的研究,而直接RNA测序则可以直接获取RNA序列信息。 젥转座酶的DNA测序 这种方法利用转座酶切割DNA,并在切割过程中加入一段序列。这段序列可以与带有马达蛋白的接头连接,从而实现快速文库构建。基于转座酶的DNA测序适用于超长测序、普通基因组测序、质粒测序和现场测序等多种应用。 快速建库测序 快速建库测序是一种高效的方法,可以在短时间内完成大量样品的测序。通过添加Barcode,可以实现多重样品的同时测序,大大提高了实验效率。 ONT牛津纳米孔测序技术在各个领域都有广泛的应用,无论是全长转录本的研究、RNA修饰的分析,还是基因组测序、质粒测序等,都能提供准确、高效的数据支持。
纳米孔测序应用于DNA甲基化研究,DNA甲基化是一种表观遗传修饰,它是由DNA甲基转移酶( DNMT)催化S-腺苷甲硫氨酸( SAM)作为甲基供体,将DNA的CG两个核苷酸的胞嘧啶被选择性地添加甲基体外诊断网的微博视频
今是科技纳米孔测序平台产业化基地正式启动开工建设
洞察科技:固态纳米孔测序技术的创新者完成数千万元天使轮融资 广州洞察科技有限公司(洞察科技)近期宣布完成了数千万元的天使轮融资,由Forcefield Ventures (IMO Ventures)领投,天图资本、雅亿资本等机构跟投。 一、融资用途 本轮融资将用于固态纳米孔检测设备的研发和应用场景扩展,预计今年下半年推出针对科研市场的固态纳米孔测序仪。 二、公司背景 洞察科技成立于2022年1月,由来自斯坦福大学、帝国理工学院等名校博士联合创立,团队在固态纳米孔制备及检测领域具有先驱地位。 三、技术创新 公司基于固态纳米孔单分子检测技术,自主研发了生物大分子检测设备和基因测序仪,以及配套的试剂耗材,具备准确、快速、低成本、小型化的特点。 四、技术优势 与传统的NGS技术相比,纳米孔单分子测序无需标记和扩增,具有测序读长长、速度快、灵活便捷等优势,能够提高基因组大型或复杂结构变异的检出率。 五、固态纳米孔的应用前景 固态纳米孔技术在稳定性、电流噪声、工艺集成方面具有显著优势,有望大幅降低测序成本,拓展到RNA测序及核酸修饰识别。 六、投资方评价 天图投资合伙人魏国兴对洞察科技的技术给予了高度评价,并认为其在DNA测序、蛋白质检测等领域具有巨大商业潜力。 七、天图投资的背景 天图投资作为国内最早从事股权投资的专业机构之一,拥有专业的投研团队和丰富的投资经验,尤其在生命科学领域有深入布局。 八、行业影响 洞察科技的技术创新和融资成功,预示着固态纳米孔测序技术将为生命科学领域带来新的检测解决方案,推动行业发展。 总结: 洞察科技的天使轮融资成功,展现了市场对其固态纳米孔测序技术的高度认可。随着技术的不断成熟和应用场景的扩展,洞察科技有望成为生命科学工具领域的新质生产力代表,为精准医疗和生命科学研究提供更低成本、更快速精准的检测产品。天图投资等机构的支持,将进一步加速公司的研发进程和市场推广,推动其在生命科学领域的长远发展。
中通量纳米孔基因测序仪之后,普译生物下一步怎么走?
英国NHS启动全球首个实时监测系统,以应对未来病毒大流行风险 近日,英国政府宣布与纳米孔基因组测序公司Oxford Nanopore展开合作,启动全球首个实时病原体监测系统,旨在加快对呼吸道感染的早期检测与治疗响应,以有效应对未来可能爆发的疫情。这一公私合营的计划预计将提升公共卫生体系对新兴病原的应对速度,并为全球疫情防控提供借鉴。 该计划的核心目标是通过快速的病原基因组测序技术,能够在短短6小时内识别病原并提出相应治疗方案。英国内阁健康和社会关怀部长Wes Streeting表示:“如果我们未能做好准备,未来将为失败做好准备。”COVID-19大流行暴露了英国公共卫生体系在应对突发传染病时的脆弱性,而该计划旨在通过提升监测技术,避免历史重演。 该系统将基于Oxford Nanopore的第三代纳米孔测序技术。通过超薄蛋白质膜上的纳米级孔道,这项技术能够实时识别DNA链中的个别核苷酸基团。该技术声称在最佳条件下准确率超过99%,并且独立测试已验证其高精度。这一技术不仅适用于快速检测呼吸道病毒,还能实时分析未知病原体。 作为此计划的重要组成部分,英国的30个NHS站点将开始使用这一先进的基因组测序技术,扩展现有的呼吸道宏基因组项目。项目所获得的数据将提供给英国公共卫生安全局(UKHSA)和基因组英格兰(Genomics England),以便对新兴的致病菌进行识别与预警。此外,UK Biobank也将参与数据共享,为该计划的顺利推进提供重要支持。 英国健康安全局的首席医学顾问Susan Hopkins强调:“早期检测对于应对新兴病原至关重要,我们将利用现有的基因组监测专业知识,并在此基础上建立更高效的反应机制,以应对未来的潜在威胁。” 除了应对流行病风险,英国政府还表示,这一合作项目将加速NHS的数字化转型,推动公共卫生体系向更高效的数字化管理模式过渡。作为英国政府十年医疗转型计划的一部分,这一举措有望提升医疗系统整体的响应能力和资源整合效率。 Oxford Nanopore公司表示,除了疫情防控,该技术在癌症早期筛查和遗传性疾病诊断方面也具有广泛的应用前景。例如,纳米孔基因组技术可用于检测新生儿的遗传性疾病,有望改变未来疾病预防的方式。通过这一技术,医学研究领域的新发现能够更迅速地转化为临床实践,推动精准医学的发展。 尽管英国政府已经宣布将从明年开始推进该计划,但具体的实施时间表和技术部署地点尚未明确。目前,计划将在10至30个NHS站点进行,但具体的站点分布仍需进一步确认。这项技术的推广不仅仅局限于流感或新冠病毒等已知病原体的检测,其潜力还在于能够对未来可能出现的未知病原提供快速识别与响应。 然而,技术的部署和普及仍面临诸多挑战。如何确保在多个地点有效实施这一高科技监测系统,以及如何在保证数据隐私和安全的前提下实现数据共享,是该计划成功实施的关键。未来,随着技术的成熟与应用的扩大,如何平衡成本效益、技术进步与公共卫生安全之间的关系,将是所有参与方需要深思熟虑的问题。#动态连更挑战# #科技# #疫情#
华大宣布纳米孔测序仪装机量突破100台,测序市场前景几何?
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今是科技“边合成边纳米孔测序技术”助力混合检材精准检测与分析
【科研进展】赵方庆团队建立复杂转录组智能实时测序新技术 真核生物的转录组由大量蛋白编码mRNA、非编码RNA和环形RNA等多种分子组成,具有高度的复杂性和多样性。因此,如何在庞大而复杂的转录组中高效、精准地检测目标转录本,成为当前生命科学及医学研究中的一个重要挑战。传统的靶向转录组检测方法需要在测序前通过探针捕获或实验富集,操作繁琐,且常常无法保留样本中的全部转录组信息,导致文库用途受限,难以用于大规模整合分析,极大制约了靶向转录组研究的应用场景。 2024年10月23日,中国科学院动物研究所赵方庆团队在Nature Cell Biology发表了题为Real-time and programmable transcriptome sequencing with PROFIT-seq的研究论文,介绍了他们开发的全转录组可编程智能测序新技术PROFIT-seq。该技术首次将全转录组捕获技术与计算机编程实时操控算法相结合,能够在测序过程中同时进行分析和富集,实现目标转录本的单分子精确检测和全转录组的无偏定量。这一创新技术可广泛适用于生命科学研究、病原体检测和临床诊断等领域。 PROFIT-seq通过创新的复合逆转录策略和滚环扩增技术,不仅能够捕获多种类型的转录本(包括多聚腺苷酸化、非多聚腺苷酸化和环状RNA等),还可以在测序过程中实时控制,根据需要选择性地富集目标转录本。此外,该团队设计了基于最大期望算法的全转录组智能定量模型,结合目标转录本的全长序列和其他非目标分子的短时测序标签,实现了精准的全转录组定量分析。与传统方法相比,PROFIT-seq大幅提高了样本中目标转录本的检测效率和测序通量。 该研究首次提出了转录组智能测序的概念,依托人工智能纳米孔自适应测序算法,能够实时判断测序分子来源,并可编程选择目标测序分子进行全长测序。这种方法无需复杂的前期实验处理,仅需提供目标转录本的参考序列,即可灵活实现测序的实时操控,满足多种类型转录本的同步检测需求。同时,通过滚环扩增技术,结合cDNA的多轮通读与纳米孔测序错误校正,实现了目标转录本的高效、精准的单分子检测。 研究团队展示了PROFIT-seq技术在多种实际场景中的应用效果。在临床检测中,该技术通过实时富集痰液样本中肺炎相关病原,大幅提高了病原体的检测通量(3-5倍),并缩短了关键突变的鉴定时间(减少75%时间),实现了快速、准确的目的病原鉴定。同时,该技术还有效检测了结直肠癌相关微生物与宿主免疫系统的复杂互作,揭示了在结直肠息肉恶性瘤变过程中,宿主免疫组库与肠道微生物的相互作用规律。 中国科学院动物研究所赵方庆研究员为该研究的通讯作者,副研究员张金阳,工程师侯玲玲以及吉林大学中日联谊医院主任医师马连君为共同第一作者。该研究得到了国家杰出青年科学基金、国家重点研发计划项目及博士后创新人才计划的资助。 文章链接:网页链接 阅文链接:网页链接
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