gtex最新视觉报道_gtex数据库官网(2024年12月全程跟踪)
阿片受体在结直肠癌中的表达:一项生信分析 背景:阿片类药物在围手术期对癌症复发的影响一直是个有争议的话题。目前,我们还没有办法根据现有的出版物来评估这个问题。为了搞清楚这个问题,我们通过免疫组织化学(IHC)来研究阿片受体在结直肠癌患者健康组织和肿瘤组织中的表达差异。 方法:我们进行了一项倾向评分匹配的病例对照研究,回顾性地分析了II期或III期结直肠癌患者的数据。主要关注的是通过IHC测量的肿瘤和健康组织之间的阿片受体(MOR)表达差异。我们还评估了匹配样本和存储在癌症基因组图谱(TCGA)中的结直肠癌样本中阿片样物质生长因子受体(OGFR)、环磷酸腺苷(cAMP)产生和蛋白激酶A(PKA)的差异。此外,我们还研究了基因型组织表达项目(GTEx)中的数据。 结果:我们发现,MOR受体和OGFR受体在肿瘤和对照组织中都有表达。然而,肿瘤组织和健康组织之间的cAMP和PKA表达,以及复发状态在这些分析变量中的表达都没有显著差异。来自TCGA数据库的MOR和OGFR表达数据与我们的样本量数据相似,肿瘤样本中MOR的表达较低而OGFR的表达较高。在有复发和无复发的患者中,肿瘤组织中的MOR表达呈偏态分布。 结论:在II期和III期结直肠癌患者中,MOR和OGFR的总体表达显著增加,但在之前匹配的有或没有复发的患者之间没有差异。这些结果通过对来自TCGA-GTEx数据库的样品进行计算机分析得到证实。
GEPIA2神器!生信分析高效 嘿,做生物信息学的朋友们!你们有没有在用张泽民教授的在线分析工具GEPIA2?这个工具真的是神器啊! 还在为代码学习头疼?GEPIA2能帮你轻松搞定生信分析,效率比自己处理数据高多了!从单基因到多基因分析,生存期(OS)、复发率(RFS)、疾病进展,还有相关性分析,一应俱全,使用起来超级方便! 主要数据源来自TCGA和GTEx项目的RNA-seq,数据量巨大,分析结果一键导出,PDF矢量图,还能编辑,简直不要太方便!老板让你调研基因表达和预后?这个工具帮你快速搞定,结果清晰,效率高! 总之,用了GEPIA2,你的生信分析工作会变得轻松又高效!赶紧试试吧!
肠道抗炎药物与精神障碍的神秘关系揭秘! 今年5月,一篇名为《Association of intestinal anti-inflammatory drug target genes with psychiatric Disorders: A Mendelian randomization study》的论文发表,影响因子高达11.4分。这篇文章通过孟德尔随机化方法,探讨了肠道抗炎药物靶标基因与精神障碍之间的因果关系,并揭示了肠道微生物群在其中的潜在中介作用。 数据来源: 文章利用了现有的表达量定量性状位点(eQTL)和蛋白质QTL的汇总数据,这些数据来自GTEx项目及公共的GWAS数据,涵盖了多种精神障碍的病例和对照组数据。此外,还使用了ROSMAP的死后大脑样本数据及欧洲人群的肠道微生物群的GWAS数据。 ᠥ析思路: 选择肠道抗炎药物靶标:识别了五种非甾体抗炎药物,并在DrugBank和ChEMBL数据库中查找这些药物的靶基因。 基因表达数据集:使用GTEx项目中的大脑eQTL数据,选择了与肠道抗炎药物靶标表达相关的基因作为工具变量(IVs)。 结果数据:从公开的GWAS数据集中获取精神障碍的遗传预测因子,包括注意力缺陷多动障碍(ADHD)、自闭症谱系障碍(ASD)、强迫症(OCD)、双相情感障碍(BD)、精神分裂症(SZ)和重性抑郁障碍(MDD)。 孟德尔随机化:使用肠道抗炎药物的蛋白质靶标的遗传变异作为IVs,进行两样本MR分析,以评估药物靶标基因表达与精神障碍之间的因果关系。 敏感性分析:对显著的MR结果进行敏感性分析,包括使用欧洲人群的GTEx数据、使用肠道基因表达作为暴露、使用全血中的全显著cis-eQTL结果,进行贝叶斯共定位分析。 两步MR中介分析:使用GWAS汇总数据,首先估计目标基因表达对中介(肠道微生物群)的因果效应,然后将中介作为暴露来评估对BD风险的因果效应。 文章解释了MR分析结果,提出了olsalazine(一种抗炎药物)可能作为BD治疗的有前景的治疗候选药物,并强调了TPMT和ACAT1在未来药物开发中的重要性。
VIKING户外鞋:值不值? 最近,VIKING品牌的户外鞋因为折扣力度大而备受关注。我也忍不住入手了两双,今天就来和大家分享一下我的使用感受。 首先,为什么买了两双呢?一方面是因为我不确定自己的尺码,另一方面则是想体验一下轻便款和秋冬款的区别。对于尺码,建议大家选择小一码的,比如我平时穿42.5码的耐克和阿迪达斯,但这双鞋穿41码才刚刚好。 接下来聊聊做工方面。轻便款的鞋面是GTEX材质,鞋底是V底,但做工有些小问题。具体来说,鞋面和鞋底的胶水似乎没给够,有些溢胶现象。鞋楦的设计也比较一般,空间较高,不压脚背。总结一下:配置不错,但做工有待提高。 再来说说秋冬款的鞋子。这双鞋的鞋面是GTEX材质,鞋底则是自家的橡胶。鞋面用料很扎实,做工也很精细,没有明显的溢胶问题。不过,中底有些厚,缺乏稳定性,容易崴脚。总的来说,这双鞋做工好,用料也不错,但没有V底和防侧翻设计。 最后总结一下:这两双鞋的价格都不贵,如果你的预算有限,可以考虑入手试试。
大生信数据库,你不可不知! 一、NCBI的GEO数据库:数据丰富,涵盖疾病、肿瘤等各类信息,单细胞测序技术也在这里得以广泛应用,是生信分析的宝藏之地! 二、文献检索神器Pubmed:轻松检索新旧文献,掌握研究进展,为生信分析提供思路与参考。 三、临床表型数据库NHANSE与SEER:孟德尔随机研究的热门,揭示暴露与结局的因果关系,为流行病学研究提供有力支持。 젥、Biobank数据库:大规模队列的GWAS数据等你来挖掘,为科研提供更多可能。 五、TCGA数据库:信息全面,临床指标丰富,是了解样本情况、实验与对照信息的绝佳选择。 젥 GEPIA与GEPIA2:支持TCGA和GTEx联合分析,提升差异表达的准确性,助力基因表达与预后分析。 頤𘃣Cbioportal:对TCGA突变数据进行整体评估与单个基因突变预后分析,提供自定义基因队列及下载功能。 八、UALCAN数据库:深入研究TCGA数据的RNA-seq,包括miRNA,并预测药物靶点,是GEPIA的有益补充。 𗠤TCIA影像组与病理组:在多模态研究中发挥重要作用,与临床、组学数据关联紧密,是科研的新兴热点。 十、The Human Protein Atlas:提供免疫组化图,省去繁琐实验,审稿人最爱!快来探索这些生信数据库吧!
天选5pro酷睿版 如果你正在考虑购买华硕天选5 Pro,那么这篇指南可能会对你有所帮助。天选5 Pro不仅外观时尚,性能也非常出色,是一款非常适合游戏和日常使用的笔记本电脑。 处理器选择 天选5 Pro目前只推出了酷睿版,主要有以下几种配置: i7 13650HX:这是英特尔13代H55系列处理器,性能略强于i7 13700HX,领先于i7 13700H。 i9 13980HX:这是去年的英特尔移动端旗舰级处理器,性能释放非常出色,强于英特尔的一众14代处理器。 i9 14900HX:基本上是上一代i9 13980HX的马甲,性能依旧强悍。如果你对CPU有更高要求,建议选择R9 7945HX。 显卡配置 ᦖ⯼天选5 Pro提供了三种配置:RTX4050、RTX4060和RTX4070。目前只有i7版本搭载RTX4050。 RTX4050:规格包括2560个CUDA核心、6GB GDDR6显存、113 GPixel/s的像素填充率、188.4 GTexel/s的纹理填充率、96bit的总线位宽、2070MHz的核心频率、2000MHz的显存频率和2355MHz的Boost频率。性能大致相当于105w的RTX3060,但由于40系优秀的功耗表现和DLSS3.5的支持,实际性能优于3060。 RTX4060:规格包括3072个CUDA核心、1470-2370MHz的加速频率、8GB显存、128bit显存位宽、35-115W功耗。支持DLSS3.5技术,游戏表现非常接近去年的RTX3070Laptop,可以在2K分辨率下畅玩几乎所有的市面主流游戏。 RTX 4070:规格包括4608个CUDA核心、1655MHz的核心频率、2030MHz的Boost频率、8GB GDDR6显存、128bit位宽、2025MHz的显存频率和140W的GPU功率(实际105W顶天)。理论测试成绩方面,3DMark Time Spy总分12328、显卡分12542,相比上一代移动版RTX 3070领先15%(实际可能没这么多),低于移动端3070ti,相较于4060并没有提升多少,性价比不高。 屏幕选择 寸 天选5 Pro有多种屏幕选择,建议选择2K165的屏幕,这样可以获得更好的游戏体验和视觉效果。天选5 Pro解决了天选4被诟病的大下巴问题,采用四面窄边框设计,屏幕亮度提升到了400nits,并拥有100%sRGB色域和DC调光。 散热设计 ❄️ 天选5 Pro在天选4冰川散热2.0的基础上增加了键盘进风口,性能释放相较于23款更加激进。 总结 总的来说,天选5 Pro是一款性能出色、外观时尚的游戏本。如果你对游戏和日常使用都有较高要求,可以考虑购买。个人建议购买i9 13980HX+4060版本,性价比和性能都非常不错。价格合适的情况下,还是很值得购买的。
赛季末冲分必备:打气月男阵容推荐 亲爱的召唤师们,今天我要给大家分享一个超强阵容——打气月男!这个阵容在赛季末冲分简直无敌,快来看看怎么搭配吧! 开局策略 3皮开局直接冲,阶段2至3-1吃满6精致连败。如果没有3皮或者月男的核心装备,可以考虑空城。 人口拉升 3-2阶段拉6人口,3-5阶段拉7人口。容错率低,如果血量低于40,可以在7人口小D一波(留20块左右)找到一张月男稳定血量,或者走连胜4-5阶段拉8人口大D一波。 装备与羁绊 找到瑟庄妮和厄斐琉斯,凑齐4枪3皮2潜行者2格斗。在8人口期间慢D两星厄斐琉斯和两星瑟庄妮。如果月男或者瑟庄妮数量超过6张,可以考虑在8人口先追一追三星四费。 转职与羁绊 如果有枪手转职,场下留一留金克丝,存钱拉9人口后凑6枪手提上限。 阵容代码 【阵容码】##打气月男##H4sIAAAAAAAAAy1MiQ0AMQhaCcT67L/YWXuYEEEBjSZQeKhWcRdLQSAshk8ExLw30QC6M0qDsJIx3dZDTpgtExB3naZzeUITQ67DV/xfGw7bIWL5jnj2D8/JmAqfWo5Qj1C5PsfXl7C9AAAA== 快来试试这个超强阵容,轻松上分不是梦!
端午登四姑娘二峰:挑战与惊喜并存 端午节的6月4日,我们8个来自各地的朋友,怀揣着对雪山的好奇与向往,踏上了征服四姑娘二峰的旅程。原计划周密,却不想天有不测风云,集合当天恰逢雅安地震,导致部分伙伴在前往成都的火车上受阻。幸运的是,他们最终还是通过多种方式赶到了成都,这段经历成为我们难忘的回忆。 6月2日,我们抵达镇上,准备装备并签订了登山合同。 6月3日,我们徒步前往二峰大本营,天气晴朗,路况良好。在高原徒步时,冲锋衣是必备的,因为它可以随着气温变化而调整穿着。防晒也是必不可少的。 6月4日凌晨3点半,我们开始冲顶。尽管天气恶劣,雪不停地下,但最终我们成功地登上了山顶。在风雪交加中,我们爬上了绝望坡,尽管雪厚过膝,但我们坚持了下来。冲顶的过程虽然艰难,但当我们站在山顶时,所有的疲惫都烟消云散了。 堥訿次登山活动中,我深刻体会到装备的重要性。在风雪天气中,雨披和材质良好的冲锋衣裤是关键。我的gtex面料冲锋衣裤在雨雪中暴露了4小时后仍然保持干燥。此外,选择全皮或gtex材质的鞋子和手套也是至关重要的。 㠦后,我们选择了臀降的方式快速下山,但代价是我的裤子后部多了两个小洞。这次经历让我明白,二峰并不是一座入门级的雪山。 这次登山之旅虽然充满了挑战和未知,但也让我们体验到了成功的喜悦和团队合作的力量。每一刻都值得铭记。
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