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Entrez权威发布_entrez数据库(2024年12月精准访谈)

内容来源：卡姆驱动平台所属栏目：观点更新日期：2024-12-02

Entrez

𐟓œ Recherchez dante, entrez dans la renaissance et documentez le monde aquatique florentin.意大利ⷤ𝛧𝗤𜦨襸‚政广场

网络药理学GO+KEGG富集分析全攻略网络药理学中的GO（基因本体论）和KEGG（京都基因与基因组百科全书）富集分析是药物研究的重要部分。以下是使用Metascape和DAVID网站进行这些分析的详细步骤： Metascape网站使用指南打开Metascape网站（metascape.org）输入基因列表并提交选择物种，点击自定义分析点击富集分析（Enrichment Analysis）选择GO分析，仅选中GO BP、CC、MF；选择KEGG分析，仅选中KEGG pathway 点击最上方的Enrichment Analysis 点击分析报告页面下载数据 DAVID网站使用指南打开DAVID网站（david.ncifcrf.gov）点击开始分析在上传区域输入基因列表在第二步中选择类型，名称选择symbol，基因ID选择entrez_gene_id 填写物种名称选择基因列表类型，提交选择功能注释工具选择想要的项目，点击图表；GO分析在Gene Ontology中选择，KEGG分析在Pathways中选择点击下载文件（不会直接下载）将新页面内容复制到Excel（仅粘贴文本） KEGG分析在Metascape和DAVID中都有包含，因此具体步骤不再赘述。

𐟧싅GG富集分析图制作指南𐟓Š 𐟔想要制作KEGG富集分析图？试试这三个在线网站吧！ 1️⃣ Metascape 𐟌 * 访问 metascape.org 网站。 * 输入你的gene list并提交。 * 选择物种，点击custom analysis。 * 点击enrichment，然后根据需要选择KEGG pathway项目。 * 点击Enrichment analysis，再点击analysis report page，最后下载数据。 2️⃣ DAVID 𐟧𞊊* 访问 david.ncifcrf.gov 网站。 * 点击start analysis，上传你的gene list。 * 在step2选择类型，名称选symbol，gene ID选entrez_gene_id。 * 填写物种名称，选择gene list，提交。 * 点击fuction annotation tool，选择KEGG项目，点击chart。 * 复制新页面内容到excel（仅粘贴文本）。 𐟎‰完成以上步骤，你就可以轻松制作KEGG富集分析图啦！快来试试吧！𐟎‰

准研究生们，这些文献查找技巧你掌握了吗？嘿，准研究生们！在复试和科研过程中，老师难免会问你如何查找文献，特别是课题背景知识。虽然有些同学可能已经会用NCBI或者Web of Science了，但还有一些细节需要注意哦。 NCBI：不仅仅是PubMed 首先，NCBI（国家生物技术信息中心）不仅仅是一个数据库，它还提供了很多工具，比如PubMed、BLAST、Entrez、OMIM、Taxonomy和Structure。特别是PubMed，这可是我们查找文献的好帮手。 PubMed使用小技巧基础搜索：在PubMed的检索框里输入关键词，比如“diabetes”，然后点击“Search”，就会弹出相关文献。是不是很简单？ ScholarScope插件：这个插件可以帮你查看文献的分数分区，还能设置筛选范围，方便你糊弄老板（哈哈，开玩笑啦）。全面检索：做背景调查时，需要看很多文献。可以写一个检索式，用OR、AND等连接关键词，这样就能获得更全面的文献。另外，PubMed还支持短语检索，用双引号（“”）来强制系统进行短语检索。学术八卦：有时候看看学术八卦也很有趣。比如，限定人名和单位，查找他发了什么文章。特别是快复试了，心仪的导师文章不去看看吗？官网上的文章可能比较早，最新的研究还是需要多了解。 Endnote来帮忙最后，别忘了用Endnote这样的文献管理软件。把文献导入Endnote，后续阅读和在Word文档中标注都方便得很。下次再分享其他经验吧，祝大家顺利找到心仪的导师，开启美好的科研之旅！𐟚€

𐟧쥅觐ƒ最全基因数据库探秘𐟌 𐟔 深入探索全球最全的基因数据库，我们发现了两个令人瞩目的数据中心。 1️⃣ 国家基因组科学数据中心（NGDC）𐟏›️ 𐟒᠎GDC专注于计算生物学与生物信息学的交叉领域，致力于将庞大的组学数据转化为科学突破。这里汇聚了生物信息学、分子生物学、计算机科学和数学等多领域的专家，他们携手整合海量数据，开发先进算法，从大数据中挖掘出珍贵的科研信息。 𐟓š 他们的研究重心在于： - 建立基于高通量测序的海量组学数据资源库，形成中国组学数据的共享平台。 - 构建中国人群的精准医学信息库，涵盖基因组遗传变异图谱等关键数据。 2️⃣ 美国国立生物技术信息中心（NCBI）𐟌 𐟒᠎CBI是生物数据的宝库，内部划分为多个子库，包括科学文献、序列数据、基因组等，所有数据通过Entrez系统紧密连接，为用户提供高效便捷的查询服务。 𐟓š 其中，GenBank数据库是NCBI的明星产品，它集成了所有公开可得的已注释DNA序列，为科研工作者提供了丰富的核酸序列信息。 𐟔젨🙤𘤤𘪦•𐦍�ƒ共同构成了全球最全的基因数据库，为科研界提供了强大的数据支持，推动了生物学的快速发展。

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