高通量筛选前沿信息_高通量筛选是什么意思(2024年12月实时热点)
科研选题:从“筛”到“猜” 在科研的汪洋大海中,如何找到那个关键的“新变量”?答案可能就藏在“筛”和“猜”这两个字里。课题的选题往往只剩下选择新的药物或分子之间的抉择。 文献查阅的误区 人们常常误以为,通过查阅文献可以找到值得研究的候选分子。然而,那些已经被报道过的“分子-表型”组合,往往默认适用于多种疾病,重复研究并无创新。真正有价值的,是那些未曾报道过的分子-表型关联,这需要你自行探索。 筛选与预测 “筛”即高通量筛选,“猜”则是预测。酸菜老师总结的这六个字,道出了科研的核心。经费充裕时,可以在模型上进行高通量筛选,同时运用预测手法,提升发现目标分子的效率。这样还能从组学结果中输出一批可视化数据图表,增加研究的表现力。 훩的境界 第一重境界:什么新、什么贵筛什么,或者一整个全筛。这种方法在课题初期找主变量时,可能会耗费大量经费,但能提升研究格调,体现硬实力。 第二重境界:分组方式不需要标新立异,只需模型和正常对照两组比较,或者模型构建好,加或者不加干预因素两组比较,差异的部分便是你开疆辟土的专属领地。 ᠨ约经费的筛选策略 最佳分组策略为两组比较,并且只筛一种分子类型。例如,只筛选mRNA等。细胞样品最少三对三(3 vs. 3)6个样品;动物或组织样品最少六对六(6 vs. 6)12个。 不筛的策略 可以找别人已经报道的筛选数据做二次挖掘分析,甚至整合多项研究的数据集汇总比较,得到一组有潜力的候选分子。大概率都能找到可用的数据集。GEO数据库是一个权威的资源,隶属于NCBI(美国国立生物技术信息中心),存储高通量数据。如果检索发现没有你想要的数据集,要小心!可能该疾病没有样本、没有模型导致无从筛起,或者研究方向太新大佬们还在做,尚未发表。这种情况若非实力超群,应注意避坑。别做人家没做过的。 分子类型的选择 主流的有蛋白和RNA。非编码RNA又分成miRNA、lncRNA和circRNA三种类型。蛋白翻译之前的形式是mRNA,mRNA表达差异介导蛋白变化,用二代测序(Next-generation sequencing,NGS)方法可以一网打尽。 测序的选择 预算不足时不建议以lncRNA/circRNA为研究对象,二选一mRNA和miRNA。mRNA的测序费用低于miRNA,所以mRNA差异比较经济。
「深大新鲜事」【医学部李国锋助理教授在Journal of Medicinal Chemistry发表靶向蛋白质降解的高通量筛选研究成果】[鼓掌][鼓掌] Ჰ24年10月31日,深圳大学医学部李国锋助理教授与中山大学洪亮教授、李民教授等合作在美国化学会药物化学权威期刊《Journal of Medicinal Chemistry》上发表题为 “Design, synthesis and activity evaluation of BRD4 PROTAC based on alkenyl oxindole-DCAF11 pair” 的研究论文。深圳大学医学部博士后赵漫、硕士研究生马文静、梁锦怡为该研究的共同第一作者。 ⛅靶向蛋白降解(TPD)是一种新兴的治疗策略,通过诱导不可成药蛋白的降解从而达到治疗目的,其中最具代表性的PROTAC分子备受关注并已进入临床研究阶段,表明了PROTAC的应用潜力。然而,逐渐显现的耐药性及PROTAC活性鉴定的低效性限制了PROTAC的快速发展。因此,开发有效的高通量筛选策略对PROTAC的发展具有重要意义。该研究团队在先前研究的基础上(PLOS Biol. 2024, 22, e3002550),新设计合成了一系列基于烯基氧化吲哚结构BRD4-PROTAC先导化合物。采用mScarlet/ EGFP 的双荧光报告细胞系,结合细胞高内涵成像技术,实现了细胞中靶蛋白降解效率的高通量高效率评估。通过这种高通量筛选策略,该团队筛选获得了一种强效的BRD4-PROTAC先导化合物L134(Dmax > 98%, DC50 = 7.36 nM)。L134不仅能显著抑制多种乳腺癌细胞的增殖,还可抑制乳腺癌细胞迁移并诱导细胞凋亡,表明了L134的抗乳腺癌潜力。[拳头][拳头] ☀这一研究成果不仅证实了基于高内涵的高通量靶向蛋白质降解筛选的有效性,也进一步证实了烯基氧化吲哚与DCAF11在蛋白降解中的应用潜力,为靶向蛋白质降解药物的研发和应用提供了有价值的借鉴。[给你小心心][给你小心心]
免疫相关生信分析:从高通量筛选到临床验证 今天,椰子老师将与大家分享如何进行免疫相关的生信分析。通过高通量筛选试验,我们鉴定了调节肿瘤细胞对GSTTKs敏感的基因。这些基因在HCC中表现出差异表达,并与预后相关。我们应用无监督聚类将HCC患者根据GSTTKs分类为亚型,并比较了不同亚组间的肿瘤微环境、代谢特性和遗传变异。 此外,我们还开发了一种基于预后GSTTKs的评分算法,称为TCscore,并评估了其对免疫治疗反应的临床和预测价值。值得注意的是,本研究的某些部分,如TTK模式和TCscore,是基于生物信息学分析的,因此需要在未来的大样本量临床试验中进行验证。 关键GSTTK和相关通路,例如NR4A3、RECQL4和RTK-RAS信号,也需要进行实验验证。总之,本研究为免疫相关的生信研究提供了新的思路,希望对大家有所启发!ᰟ
制药工程专业学生必看:药物研发全解析 制药工程不仅仅是简单的药物制造它融合了化学、生物学和工程学等多学科知识죀在研发新药时,首先需要确定疾病的靶点ﯼ就像找到锁孔。然后通过高通量筛选等方法,从众多化合物中找到能开锁的“钥匙”,也就是潜在的药物分子。 研究方法上,常用的有药物合成,精心构建分子结构쯼还有药物分析,精确检测药物的纯度、含量等各项指标。细胞实验与动物实验也是必不可少的,观察药物在生物体内的反应与效果为走向临床应用打下坚实的基础ꣀ
北京:大力发展融合高级别自动驾驶技术的智能网联新能源汽车产业 北京发布关于加快建设国际绿色经济标杆城市的实施意见。其中提到,积极培育合成生物制造产业。强化生物制造菌种计算设计、高通量筛选、基因编辑等创新突破。其中还提到,大力发展融合高级别自动驾驶技术的智能网联新能源汽车产业。 点评:自动驾驶明天轮动一下
升级你的筛选工具! 还在用报告基因做小分子筛选?是时候考虑升级你的工具了!虽然荧光蛋白或荧光素酶的报告基因系统很受欢迎,但它有一些局限性哦。 比如,它不能完美反映基因的真实表达情况,只能检测1-2个基因,而且操作繁琐,不适合高通量筛选。 那怎么办呢?别担心,“昕瑞再生”推出了Drug-seq2技术,它采用3’端测序,无需提取RNA,就能精准定量RNA,而且支持少量细胞和大规模样本的高通量qPCR试剂盒哦! 是不是听起来很心动?现在就开始行动吧,让你的筛选工作更上一层楼!
药物研发新突破:靶点筛选的7大黑科技 在药物研发的广阔天地中,你是否曾好奇那些能够精准打击疾病的“神奇子弹”是如何诞生的?今天,我们将带你探索靶点筛选的前沿科技,体验从靶点找到药物,再从药物找到靶点的双重魅力! 20K芯片 —— 高通量筛选神器,一次性检测2万个靶点,快速发现潜力新星! 전ARTS —— 达尔文式进化筛选,让药物与靶点自然“配对”,加速新药发现! 砌ip-MS —— 脂质组学质谱联用,精准描绘细胞膜上的靶点地图,为药物设计导航! ull down + Ms —— 靶向捕获与质谱分析强强联手,锁定“真命靶点”,让药物研发不再盲目! 𘯸 Spider —— 网络药理学新视角,构建药物-靶点互作网,揭示复杂疾病背后的“秘密通道”! ꠃetsa+ Ms/TPP —— 细胞热位移分析结合质谱/透皮肽,为药物递送提供新思路! 记&非标记策略 —— 双重策略并进,灵活应对不同靶点挑战,让药物研发更加精准高效! 这些黑科技正在悄然改变药物研发的格局,让从靶点找到药物,再从药物找到靶点不再是遥不可及的梦想!
「科技前沿科普」【药物高通量筛选系统促进软骨再生】南方医科大学基础医学院教授白晓春和高学飞团队开发出人软骨类器官高通量药物筛选系统鉴定软骨再生新靶点。相关成果近日发表于《细胞-干细胞》(Cell Stem Cell)。「千万IP创科普」(中国科学报)药物高通量筛选系统促进软骨再生
「广东向新」药物高通量筛选系统促进软骨再生 南方医科大学基础医学院教授白晓春和高学飞团队开发出人软骨类器官高通量药物筛选系统鉴定软骨再生新靶点。相关成果近日发表于《细胞-干细胞》。网页链接
10月27日重点财经新闻汇总 1、常山北明:拟引入与软件业务有协同效应的新能源及智慧城市业务,同时剥离纺织业务。 2、财政部副部长廖岷:除货币政策外,中国还将加大财政政策逆周期调节力度,中国有信心实现全年5%左右的经济增长目标。 3、统计局:1—9月份高技术制造业利润同比增长6.3%。 4、北京: (1)大力发展融合高级别自动驾驶技术的智能网联新能源汽车产业。 (2)积极培育合成生物制造产业 强化生物制造菌种计算设计、高通量筛选、基因编辑等创新突破。 (3)大力发展先进能源产业,力争到2035年全面建成国际绿色经济标杆城市。 5、中金公司:思尔芯IPO保荐业务未勤勉尽责,中金公司被证监会给予警告并处以罚款。 6、纽交所:计划将旗下NYSEicon Arca的美股交易时间延长至每个工作日22个小时。 7、氢能和海上风电:澳大利亚和英国表示,两国计划共同努力,加大绿色氢能和海上风电等可再生能源技术的应用,以支持脱碳。
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5000年前的日出曾被这样记录下来
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这件大口尊刻着一场5000年前的日出
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