当前位置：网站首页 » 话题 » 内容详情

转座子最新娱乐体验_转座子的发现(2024年11月深度解析)

内容来源：卡姆驱动平台所属栏目：话题更新日期：2024-11-28

转座子

Evo模型：基因解析新突破！大语言模型在解读生物序列数据方面展现出巨大潜力。Nguyen等人提出了一种名为Evo的多模态人工智能模型，它能够大规模地解释和生成基因组序列。Evo的架构基于深度学习技术，使其能够高效处理长序列。通过分析数百万个微生物基因组，Evo对生命复杂的遗传密码（从单个DNA碱基到整个基因组）有了全面的理解。这使得该模型能够预测小的DNA变化如何影响生物体的适应性，生成真实的基因组长度序列，并设计新的生物系统，包括实验室验证的合成CRISPR系统和IS200/IS605转座子。Evo代表了我们在多模态和多层次复杂性方面理解和工程生物学能力的重大进步。这项研究由加州大学伯克利分校Arc研究所的Patrick Hsu与斯坦福大学Brian L. Hie领导的研究团队完成。

CC论坛，中国科学院大学建校46周年专场联合校友会共同主办。适逢周六所以应邀前来聆听因为思想无界但和而不同，多个研究所研究员分享了以转座子为代表的新课题：进化的隐藏力量、跳跃基因如何驱动生物进化，向自然学习、绿肥田菁、让“八百里瀚海”破“碱”重生，见微知著、超导材料研究领域的传承者。「带着边框一起拍」北京ⷤ𘭥›𝧧‘学院大学玉泉路校区

张锋团队发布新型基因编辑工具IS110 𐟓… 近期，张锋课题组在 Nature 杂志上发表了两篇研究，揭示了一种全新的第三代基因编辑工具——IS110。这一发现可能标志着基因编辑技术的新篇章，挑战了CRISPR的地位。 𐟔젨𝬥𚧥퐯𜌥𓨷𓨷ƒ基因，分为插入序列 (IS) 和复合转座子两类。IS110就是其中一种新型基因编辑工具，它基于转座子的功能进行扩展。 𐟔„ IS110元件的结构和生命周期：IS110依靠自编码的重组/转座酶从基因组中切除自己，并在切除基因两端后自环化成环状结构。这个环状结构包含非编码RNA（ncRNA）片段，类似于向导RNA的角色。 𐟌€ 桥RNA（bridge RNA）的识别模式：桥RNA具有两个内部环状结构，通过直接的碱基配对相互作用同时识别靶位点DNA和供体DNA，起到桥接两种DNA片段的作用。这种双特异性识别模式相较于已知RNA引导系统（gRNA）的单链碱基配对机制，可能更精准。 𐟒ᠤ𜘥Š🯼š 1️⃣ 桥RNA的识别模式可能比CRISPR/Cas9基因编辑技术更精准。 2️⃣ 桥RNA不需要其他内源性酶（如同源重组酶）的参与，可能更容易修饰。 3️⃣ 提供了一种新的基因编辑工具，有助于大片段基因片段的插入等编辑操作。 𐟓ˆ 随着科学技术的不断进步，基因编辑技术也在不断演进。IS110的发现为基因编辑领域带来了新的可能性和挑战。

NGS文库构建中的关键酶：一文全解 𐟔슎GS测序流程大致分为四个步骤：样本制备、文库构建、上机测序和数据分析。在实验过程中，酶的作用至关重要。今天，我们来聊聊文库构建中的关键酶。 DNA片段化：选择合适的酶很重要 ✂️ 首先，我们需要将大片段的基因组DNA片段化为小片段。目前市场上的测序仪测序长度通常在150-500bp之间，所以我们需要用机械打断或酶切打断的方法来实现。机械打断虽然有效，但操作复杂且损耗大。相比之下，酶切法成本更低，操作更简便。常用的片段化酶有两种：一种是基于转座子原理的Tn5转座酶，另一种是核酸内切酶的混合酶。这两种酶都能有效地将DNA片段化，为后续步骤打下基础。末端修复与加“A”：精细操作的关键 𐟔犊打断后的DNA会产生5'/3'黏性末端和平末端。在使用TA连接的方式进行接头连接时，DNA片段还需要5'端磷酸化和在3'端加“A”，才能与带“T”黏性末端的接头互补配对。这个过程由T4 DNA聚合酶、T4多聚核苷酸激酶和Taq DNA聚合酶共同完成。 T4 DNA聚合酶：多功能酶的妙用 𐟌 T4 DNA聚合酶具有5'→3'DNA聚合酶活性，可以补平5'突出末端；同时，它也具有3'→5'外切酶活性，能够切平3'突出末端，将含黏性末端的DNA片段转变为平末端DNA。 T4多聚核苷酸激酶：磷酸基团的转移者 𐟚€ 由于人工合成的PCR引物、接头等5'端通常都是羟基基团而不是磷酸基团，因此需要T4多聚核苷酸激酶在ATP存在时催化ATP的磷酸基团转移到寡核苷酸链的5'端羟基末端上，为下一步连接接头做准备。 Taq DNA聚合酶：添加核苷酸“A”的能手 𐟏𗯸 Taq DNA聚合酶具有5'→3'聚合酶活性，可以从5'→3'方向合成DNA，同时它具有的脱氧核苷酸转移酶活性可以在PCR产物的3'末端添加一个核苷酸“A”。总结 𐟓 在NGS文库构建过程中，选择合适的酶至关重要。通过上述步骤，我们可以将大片段的基因组DNA片段化为小片段，并加上通用接头序列，通过PCR扩增获取足够多的文库核酸分子，为后续的上机测序和数据分析打下基础。

英国伯明翰大学细菌进化博士项目开启！嘿，对细菌进化与抗生素耐药性感兴趣的小伙伴们注意啦！伯明翰大学正在开放申请一个超酷的博士研究项目——揭秘细菌如何“加速”进化来抵抗抗生素！这是一场关于生命法则的探索之旅，绝对值得你参与！关于伯明翰大学伯明翰大学可是英国“红砖大学”之一，还是罗素集团的成员，拥有超过百年的教学与科研历史。学校有8000多名教职员工和38000多名学生，以教育质量和研究实力闻名。特别值得一提的是，2024年英国高校就业能力排名中，伯明翰大学可是位列第一哦！作为研究生培养的翘楚，这里将为你提供顶级的学术支持与发展平台。项目亮点这个项目由伯明翰大学生物科学学院主导，专注于细菌进化与抗生素耐药性研究。具体研究方向是探究DNA转座子（跳跃基因）在细菌“超速进化”中的作用机制。简单来说，就是希望通过研究这个机制，为解决全球抗生素耐药性危机提供新思路。学院的学术实力也很强大，在最新的REF评估中，45%的研究成果被评为“世界领先”，科研设施也是全球一流！你将参与的研究内容如果你加入了该项目，你将：开展细菌进化分子机制的实验研究；用生物信息学分析基因组变化规律；撰写学术论文，参与国际会议交流；与导师及团队合作，共同推动研究突破。我们期待这样的你想申请？那你需要满足以下条件：学术背景：生物学、生物化学或相关领域的硕士学位；研究经历：熟悉细菌学、生物信息学或分子生物学研究；技能优势：掌握分子实验技术、数据分析能力，并具备团队协作精神。你将获得的福利技能提升：掌握分子技术和计算分析能力；导师加持：顶尖导师团队，全程一对一指导；国际交流：与全球学者合作，打开学术新视野；资源支持：顶级科研设备和丰厚资金，为你的研究保驾护航！毕业后，你的未来可期学术方向：引领细菌进化与耐药性领域的突破性研究；生物医药：从事医药研发，成为行业稀缺人才；实际应用：助力抗生素耐药性解决方案的实现。加入伯明翰大学，你将不仅探索生命的奥秘，更为解决全球健康难题贡献力量。心动了吗？快来开启你的博士旅程吧！ 𐟚€

保研夏令营DAY1：名词解释今天是保研夏令营英文问题的第一天——名词解释篇！𐟓š 1️⃣ 请用英文解释SNP！ ⚠️ 在英文名词解释中，只需语法和语序无误，抓住关键词汇，翻译准确即可（如果能加上一个例子就更好了）！ 𐟓 分子生物学方向 SNP位点｜基因重组｜DNA半保留复制｜转座子 𐟓 生产栽培方向定植｜嫁接｜出苗率｜春化作用 𐟓 植物识别方向一年生和多年生｜宿根植物｜水生植物｜短日植物英文名词解释的准确性可以大大提升我们在面试中给老师留下的专业印象！因此，在准备夏令营时，严谨的英文训练是必不可少的！𐟌Ÿ 𐟍€ 糊涂猪频道将持续追踪农学保研相关的最新讯息，与大家共度保研季，直面焦虑，共拿offer！之后我们还会分享入营资料整理、简历、个人陈述、邮件回复等内容！ 𐟍€ 糊涂猪频道分享及指导： 𐟓 保研院校定位 𐟓 专业背景优化 𐟓 文书写作指导 𐟓 个人优势分析 𐟓 交流邮件分享 𐟓 导师选择利弊

DNA文库构建，一文读懂！嘿，大家好！今天咱们来聊聊DNA文库构建的那些事儿。其实，这个过程还挺有意思的，尤其是对于那些喜欢搞科研的小伙伴们。好了，废话不多说，咱们直接进入正题吧！片段化：第一步也是最关键的一步 𐟔ꊊ首先，咱们得把提取出来的DNA片段化。为什么呢？因为测序仪的读长有限，不能直接把整段DNA放进去测序。所以，我们需要把DNA剪切到适合的长度。现在常用的方法有两种：超声破碎法和酶切法。机械打断：操作复杂但效果不错 𐟔犊机械打断就是用一些物理方法把DNA打碎。虽然这种方法对样本的损耗比较大，操作也复杂，但它确实挺有效的。不过，市面上更常用的还是酶切法。酶切法：操作简便，成本低 𐟒𘊊酶切法就是用一些特定的酶来打断DNA。相比机械法，酶切法的成本更低，操作也更简便。你只需要加入片段化酶，然后反应一段时间就行了。目前常用的片段化酶是基于转座子原理的Tn5转座酶。 Tn5转座酶：背后的原理 𐟔슊Tn5转座酶最早是从E. coli中发现的一种细菌转座子。它的序列主要包括四个部分： IS50、IS50R和IS50L：这些序列高度同源。IS50R上的Tnp和Inh分别编码转座酶（Tnp）和转座抑制因子（Inh）。Inh可以和Tnp形成多聚体复合物，从而抑制Tnp介导的转座。 OE序列：由19个碱基组成，可以被Tnp识别，参与整个Tn5的转座。 IE序列：不参与Tn5的转座，但参与IS50的转座。耐药基因：Tn5上的耐药基因主要有kan、str和ble。总结 𐟓 无论是机械打断还是酶切法，最终的目的都是为了把DNA片段化，方便后续的测序工作。希望这篇文章能帮到你们，对DNA文库构建有个更清晰的认识！如果有任何问题或者想法，欢迎在评论区留言哦！

凌乱的脚步𐟑㦝‚乱的思绪……到底是不是转座子的缘故[拜拜]

【鬼谷闲谈】病毒：生于三界之外不灭六道之中很多小伙伴希望我们讲讲病毒的故事，唔，正好鬼谷菌的专业和这有些关系，就来唠唠吧！芳斯塔芙的微博视频

𐟧짨𓨽짻†胞系构建全攻略𐟒ኦž„建稳转细胞系，这些方法你必须知道： 1️⃣ 慢病毒法：利用慢病毒载体，将目的基因稳定整合到细胞基因组中。 2️⃣ 转座子法：通过转座子技术，实现目的基因在细胞中的稳定表达。 3️⃣ CRISPRa法：利用CRISPR-a系统，精确编辑细胞基因，达到稳定表达的目的。 4️⃣ Knockin法：通过基因敲入技术，将目的基因插入到细胞基因组特定位置。 𐟤”构建时遇到这些问题怎么办？ ✅ 密码子优化：针对长基因，优化密码子可大幅提升蛋白表达量。 ✅ Kozak序列：真核生物mRNA翻译起始的关键序列，确保蛋白正确翻译。 ✅ 启动子选择：根据细胞类型和基因长度，挑选合适的启动子。 ✅ 培养体系调整：根据细胞代谢需求，调整培养体系，维持细胞最佳生长状态。 ✅ 标签位置选择：根据蛋白特性和纯化需求，合理放置标签。 𐟚릳覄：不建议构建稳转敲除的细胞系，以避免脱靶效应对细胞状态的影响。遵循这些步骤，你的稳转细胞系构建将更加高效与精准！✨

专栏内容推荐

744 x 420 · png
[遗传学]转座因子的结构与功能-CSDN博客
素材来自:blog.csdn.net
1674 x 1020 · png
转座子随机插入突变体库——获得新靶点的绝佳方式 - 知乎
素材来自:zhuanlan.zhihu.com

600 x 565 · jpeg
跳跃“精灵”：神奇的转座子 - 知乎
素材来自:zhuanlan.zhihu.com
600 x 300 · jpeg
转座子的分类
素材来自:wenwen.sogou.com

600 x 153 · png
转座子随机插入突变体库——获得新靶点的绝佳方式 - 知乎
素材来自:zhuanlan.zhihu.com

600 x 346 ·
神奇的转座子：转座子的分类 - 知乎
素材来自:zhuanlan.zhihu.com
1415 x 941 · jpeg
转座子 - 知乎
素材来自:zhuanlan.zhihu.com

960 x 616 · jpeg
转座子_360百科
素材来自:baike.so.com
1788 x 1571 · jpeg
转座子工具-Transposon tools - 哔哩哔哩
素材来自:bilibili.com

886 x 430 · jpeg
转座因子-智汇三农
素材来自:pwsannong.com

600 x 550 · jpeg
基因里的Ctrl C+V：转座子 - 知乎
素材来自:zhuanlan.zhihu.com
988 x 1140 · jpeg
【维真生物-科研小知识】Piggy Bac转座子介绍_细胞
素材来自:sohu.com

1000 x 678 · jpeg
Jungnam Cho研究组揭示活跃转座子识别及表观沉默机制 - 生物通
素材来自:ebiotrade.com
474 x 453 · jpeg
科研干货 | 一文了解“跳跃基因”——转座子 - 知乎
素材来自:zhuanlan.zhihu.com

600 x 294 · jpeg
转座子介导的稳转细胞系的构建 - 知乎
素材来自:zhuanlan.zhihu.com

600 x 139 · jpeg
跳跃“精灵”：神奇的转座子 - 知乎
素材来自:zhuanlan.zhihu.com

1420 x 1003 · jpeg
blaKPC基因相关的转座子结构概述一 - 知乎
素材来自:zhuanlan.zhihu.com
600 x 802 ·
神奇的转座子：植物中转座子的分布 - 知乎
素材来自:zhuanlan.zhihu.com

895 x 1024 · jpeg
【在线解读】IF=16.24 棉花转座子与基因组三维结构进化的奥秘 | | 百迈客生物
素材来自:biomarker.com.cn
1080 x 992 · jpeg
升级版转座子CRISPR-Cas系统电镜图揭示如何精准插入大片段DNA 学术资讯 - 科技工作者之家
素材来自:scimall.org.cn