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细胞通讯最新视觉报道_细胞通讯分析(2024年12月全程跟踪)

内容来源：卡姆驱动平台所属栏目：热点更新日期：2024-11-30

细胞通讯

12个细胞信号通路详解，科研必备！细胞信号通路是生物学研究的重要领域，以下是12个重要的细胞信号通路，供科研人员参考： MAPK信号通路 𐟌 MAPK信号通路在细胞增殖、分化和凋亡中发挥关键作用。 PI3K/AKT信号通路 𐟚抠这个通路参与细胞的生长和存活，与肿瘤发生和发展密切相关。 RTK相关信号通路 𐟓𖊠 受体酪氨酸激酶（RTK）相关信号通路在细胞通讯和信号转导中至关重要。 TGF-B超家族信号通路 𐟏አ 转化生长因子𜈔GF-B）超家族信号通路在细胞生长、分化和免疫调节中发挥作用。 Wnt信号通路 𐟐㊠ Wnt信号通路与胚胎发育、细胞增殖和分化密切相关。 NF-KB信号通路 𐟔加 NF-KB信号通路在炎症反应和免疫应答中扮演重要角色。 Notch信号通路 𐟔„ Notch信号通路在细胞分化、凋亡和肿瘤发生中发挥作用。 Hippo信号通路 𐟐𔊠 Hippo信号通路与组织生长和器官大小调控有关。 Hedgehog信号通路 𐟦” Hedgehog信号通路在胚胎发育和肿瘤发生中发挥作用。核受体相关通路（激素类） 𐟒Š 核受体相关通路在激素调节和代谢中具有重要意义。 JAK/STAT信号通路 𐟓ˆ JAK/STAT信号通路在细胞生长、分化和免疫调节中发挥作用。 AMPK信号通路 𐟒ꊠ AMPK信号通路与能量代谢和细胞存活有关。这些信号通路的研究对于理解细胞生物学和疾病发生机制具有重要意义。希望这些信息对科研人员有所帮助！

细胞生物学导论：从基础知识到前沿研究 𐟓š 细胞生物学笔记 𐟔 细胞：构成生物体的基本单位，具有复杂的结构和功能。 𐟌 细胞生物学：研究细胞的分子组成、结构、功能和行为的科学。 𐟓Œ 细胞的结构与功能：细胞膜：保护细胞，控制物质进出。细胞核：遗传信息的存储和复制。细胞质：进行各种代谢活动。 𐟔젧𛆨ƒž生物学的应用：医学研究：通过研究细胞，发现疾病的治疗方法。生物技术：利用细胞进行药物研发、农业改良等。 𐟔�𛆨ƒž生物学的历史与未来：发展历程：从早期对细胞的观察，到现代分子生物学技术的应用。未来趋势：基因编辑、细胞疗法等前沿领域的研究。 𐟓𗠧𛆨ƒž的多样性：不同生物的细胞具有不同的形态和功能。同一生物体内，不同组织和器官的细胞也有差异。 𐟔 细胞的生长与分裂：细胞生长：通过增加细胞体积和复杂度来适应环境变化。细胞分裂：通过复制自身来增加细胞数量。 𐟓š 细胞通讯与信号转导：细胞间通讯：通过化学信号、物理接触等方式进行信息传递。信号转导：细胞内信号转导路径，影响细胞的生理活动。 𐟌𑠧𛆨ƒž的起源与进化：细胞的起源：从非细胞生物到细胞的演化过程。细胞的进化：适应环境变化，发展出多样性的细胞类型。

干敏皮刷酸不翻车！这组修护精华太棒了大家都知道刷酸的好处，但很多人一刷就翻车，以为自己不适合。其实，很多时候不是大家不适合刷酸，而是忽略了刷酸前后的维稳修护工作。刷酸后，如果没有做好修护，皮肤在紫外线的照射下会出问题，导致泛红、烂脸等问题。我也曾经翻车过，但后来总结了一些经验。刷酸后，修护精华的选择非常重要。我一直在用雅诗兰黛的第七代小棕瓶，它让我在刷酸的同时也能维稳修护肌肤，逐渐在刷酸的路上成功了。现在，我的小脸蛋越来越有光泽感。小棕瓶有着独特的修护科技，可以重启细胞间修护信号。就像打仗时部队与指挥官的通讯信号被阻隔，那这注定是一场败仗；反之，如果能抢占先机把通讯基站修好，细胞通讯正常，指挥官成功发送正确指令，这场战就能顺利打下去了。在对的指示下，做对的事，这就是重启细胞修护信号的关键。它能轻松满足刷酸后护肤需求，提升皮肤的防护力，加速新陈代谢，从内到外修护肌肤。作为老忠粉，我坚持用小棕瓶，感觉肤质也变得越来越强韧，比之前更细腻透亮，摸上去脸蛋也弹润。小棕瓶在我心中真的无可替代！以防万一，刷酸爆痘、泛红严重的时候，我还会搭配高能小棕瓶。这对「修护双星」来急救皮肤，效果真的翻倍！高能小棕瓶能即刻舒缓肌肤，镇定痘痘的效果非常显著。它能精准找到烂脸的位置，从而更好地修护皮肤，加强肌肤的屏障，有效褪红，痘痘也能瘪下去不少。总的来说，这组修护双星精华真的是我刷酸路上不可或缺的好伙伴！有它们帮我保驾护航，以后再也不用担心刷酸的问题了！

C罗6度征战欧洲杯，低体脂率的秘密 ⚽️ C罗，这位足球巨星，已经六度征战欧洲杯了！你知道吗？有媒体报道，C罗的体脂率竟然只有7%，而职业足球运动员的平均体脂率一般在10%-11%之间。一般来说，男性的体脂率在15%-18%之间，女性则在25%-28%之间被认为是正常的。如果男性超过20%，女性超过30%，那就通常被认为是肥胖了。 𐟏‹𐟏𛠤𝓨„‚百分比是什么？体脂百分比就是体内脂肪量占全身重量的百分比。体脂率过高或过低都会有不好的影响。 𐟚㰟𛠥†…脏脂肪和体脂百分比内脏脂肪是积聚在腹部器官周围的脂肪，比如肝脏、胰腺和肠道。与皮下脂肪不同，内脏脂肪更深，看不见。体脂百分比和内脏脂肪水平是同步上升的，所以体脂率高的人内脏脂肪也可能高，这样会增加患慢性病的风险。 𐟥Š 在家测体脂你可以在家里使用体脂监测秤，虽然不完全准确，但可以提供近似值，并且随时间推移展示趋势。 𐟏 体脂率与健康寿命一项发表在《美国老年医学学会杂志》上的研究发现，与体脂百分比较低的老年人相比，体脂百分比较高的老年人的健康寿命较短。另一项发表在《欧洲临床营养学杂志》上的研究发现，低体脂率与老年人的死亡风险较高有关。2023年的一项研究也发现，老年人的全因死亡率与体重减轻之间存在显著关联。 ⛷ 其他影响因素当然，寿命还会受到其他因素的影响，比如饮食、运动和遗传。 ⛸ BMI和衰老的标志线粒体功能障碍、细胞衰老、细胞通讯改变、基因组不稳定性、表观遗传改变、端粒缩短、营养传感失调和干细胞耗竭都受BMI和体脂百分比的影响。特别是，线粒体功能障碍与肥胖和高体脂率有关。一项发表在《临床内分泌与代谢杂志》上的研究发现，肥胖个体的线粒体功能受损。 𐟏‡ 炎症与衰老炎症也是衰老的标志，已被证明与BMI和体脂百分比有关。过多的身体脂肪会导致慢性低度炎症，这与几种慢性疾病有关。 𐟏Š𐟏𛠤𝓨„‚对长寿的重要性总之，保持健康的体脂百分比和内脏脂肪水平对整体健康和健身至关重要。你必须专注于将其他健康习惯纳入日常生活中，比如定期锻炼、均衡营养、适当的进餐时间和压力管理。通过保持健康的体脂百分比和内脏脂肪水平，你可以降低患与年龄有关的疾病的风险，并提高整体生活质量。

单细胞与空间转录组学揭示细胞通讯新模式在《Nature Methods》杂志上，有一篇题为《通过单细胞和空间转录组学推断驱动模式的细胞间流动》的文章，真是让人眼前一亮。这篇文章提出了一种全新的方法来研究细胞通讯，让我对细胞通讯的复杂性有了更深的理解。传统上，我们进行细胞通讯分析时，可能只关注单个基因的变化。但这篇文章告诉我们，当细胞受体接收到信号刺激时，实际上是一个由多个基因构成的基因模块在发生变化。这个模块可能包含我们感兴趣的下游分子或转录因子，甚至可能与某些临床表型（如预后或疗效）有关。文章中提到的FlowSig算法，完美地解决了这些问题。无论是单细胞转录组测序还是空间组学，都能从中推断出细胞间通信驱动的细胞间流动。这种方法揭示了细胞间信息流动的复杂性，为多种疾病的研究提供了新的视角。具体来说，文章中提到的FGF受体（FGFR1和FGFR3）是输入信号的来源，而GEM模块则是这些信号引起的细胞内变化。这些变化会促使细胞释放一系列配体。以前的研究中并没有包含GEM这个中间过程。总的来说，这篇文章为我们提供了一个全新的研究细胞通讯的框架，让我们能够更深入地理解细胞间的复杂相互作用。

单细胞测序：揭秘细胞通讯 𐟌Š 在单细胞测序的世界中，细胞通讯是一个充满奥秘的领域。今天，我们将深入探讨如何使用R包来分析这些复杂的细胞间交互。 𐟓栧”褺Ž细胞通讯计算的R包： cellchat ITALK CellphoneDB NicheNec SingleCellSignalR 𐟔 我选择的是cellchat这个R包，它能够从单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中定量推断和分析细胞间通讯网络。通过整合基因表达与信号配体、受体及其辅助因子之间的相互作用的先验知识，它能够建立细胞-细胞交流的概率，进而对细胞间通讯做出预测，并提供多种可视化方法。 𐟓ˆ 分析过程：建立cellchat分析对象：包括Seurat对象中的数据和元信息，以及导入cellchat中自带的CellchatDB数据集作为分析参考数据库。识别过表达基因：找出那些在特定细胞类型中表达量异常高的基因。识别过表达配体受体对：确定哪些配体和受体对在特定条件下表达量显著增加。使用原始数据或PPI投影后的结果推测细胞互作的概率：通过这些数据，我们可以推测不同细胞之间的相互作用。筛选剔除通讯数量少的细胞：去除那些在通讯网络中贡献较小的细胞。计算每个信号通路相关的所有配体-受体相互作用的通信结果：这可以帮助我们理解不同信号通路在细胞通讯中的作用。计算整合的细胞类型之间通信结果：通过这种方式，我们可以获得更全面的细胞通讯网络视图。细胞通讯结果可视化：将复杂的通讯网络转化为直观的图形，如层次聚类图、热图、桑基图等。 𐟎蠥﨧†化类型：层次聚类图：展示不同细胞类型之间的层次关系。热图：通过颜色深浅表示基因表达量的高低。桑基图：显示不同细胞类型之间的通讯流量。降维投影图：将高维数据投影到二维或三维空间中。相似性：计算不同细胞之间的相似性得分。和弦图：展示多个变量之间的关系。环状图：通过环形图表示不同细胞类型之间的通讯关系。气泡图：在气泡图中显示不同细胞类型的通讯强度和数量。 𐟓Š 结果展示：我使用两个组的数据当成单个样本集进行分析，这只是为了初步了解cellchat的分析过程。在实际研究中，我们可能会遇到更复杂的数据集和更细致的分析需求。通过这些步骤，我们可以更深入地理解细胞通讯的复杂网络，为疾病研究和药物开发提供有力的支持。

普通生物学第四章细胞结构与通讯思维导图 𐟌ˆ今天我们继续分享陈阅增先生《普通生物学》第四版第3章的第二部分，第一部分的内容可以在主页找到。 𐟑‰𐟏𛧬쳧렢€”细胞结构与细胞通讯Ⅱ 这部分内容主要总结了真核细胞的代表性细胞器、细胞骨架和细胞连接三部分。以下是对这些内容的详细分析：细胞核：非常重要✅ 细胞核是细胞的控制中心，主要以小题形式考察细节。特别要注意核小体的名词解释，以及“细胞核的结构与功能”简答题。内质网与核糖体：非常重要✅ 内质网有两种类型，核糖体也有两种，各自的结构与功能都需要掌握。这部分内容是考频最高的细胞器。高尔基体和溶酶体：一般重要这两种细胞器有密切联系，溶酶体是由高尔基体外运侧出芽形成的。液泡：一般重要液泡不仅存在于植物细胞中，某些原生动物如变形虫、草履虫也以食物泡形式存在。线粒体和质体：非常重要✅ 质体以叶绿体为代表，要注意对比线粒体和叶绿体的异同，这部分内容可能会出简答题。微体：考频较低，一般了解微体的具体结构和功能可以参考教材，不需要深入掌握。细胞骨架：重要✅ 三种细胞骨架的结构和功能都要对应好，可以整个出名词解释，也可单独出某一个。细胞壁以及细胞连接：一般重要细胞连接和细胞通讯在普生考试中出名词解释的概率很大，这部分内容是复试科目细胞生物学的重要知识点。以上分析更加针对考华南师范大学学科生物906的同学，其他学校的同学也可做参考。希望大家好好学！

细胞奥秘揭晓！丁明孝《细胞生物学》 𐟌🠧𛆨ƒž，作为生命科学中最引人入胜的部分之一，其复杂性和神秘性令人着迷。丁明孝教授，作为细胞生物学的杰出代表，他的研究涵盖了细胞结构、功能以及细胞间相互作用的多个方面。今天，我们将一起探索这个微观而又神奇的细胞世界。 𐟔젤𘁦˜Ž孝教授的研究不仅揭示了细胞生命的奥秘，更为后续的研究者提供了宝贵的思路和方向。他的学术成就让我们得以窥见细胞内部那复杂的分子机器如何协同工作，支撑起生命体的基本功能。 𐟧젧𛆨ƒž膜如何调节物质进出，细胞骨架如何维持细胞的形态和移动性，这些都是细胞生物学领域的核心内容。更让人惊叹的是，细胞间的相互作用和通讯机制。它们如同一个庞大的社交网络，通过信号分子的传递，实现信息的交流和响应。这种精细而复杂的调控机制，正是生命体能够应对外界环境变化，保持内部稳定的关键。 𐟓š 丁明孝教授的研究不仅为我们提供了丰富的理论知识，更激发了我们对细胞世界的无限好奇和探索欲望。他严谨的科研态度、深厚的学术功底以及不懈的求知精神，都是值得我们学习和借鉴的。 𐟌𑠨ˆ‘们继续跟随丁明孝教授的步伐，深入探索这个充满奥秘的细胞世界。在微观的尺度上，感受生命的神奇与美妙！

单细胞转录组数据分析全流程详解 𐟔 单细胞转录组数据分析流程涵盖了从数据预处理到高级分析的多个步骤，旨在深入理解细胞间的复杂关系。以下是详细的分析流程： 1️⃣ 样本质控与数据预处理：确保数据的准确性，去除低质量细胞，进行必要的预处理步骤。 2️⃣ 降维与聚类：通过降维技术减少数据维度，便于后续聚类分析，识别不同的细胞亚群。 3️⃣ 双细胞去除与多样本整合：利用Harmony等方法去除双细胞，整合多个样本的数据，提高分析的可靠性。 4️⃣ 细胞亚群注释：为每个细胞亚群赋予生物学意义，便于理解其功能。 5️⃣ NNLS与亚群细分：通过NNLS算法提取感兴趣的亚群，进行重新聚类，进一步细分细胞类型。 6️⃣ 细胞比例与差异基因分析：计算不同细胞的比例，识别差异表达的基因，并进行可视化展示。 7️⃣ Marker基因与功能富集分析：计算Marker基因，进行GSVA分析、GO/KEGG富集分析，揭示细胞亚群的功能差异。 8️⃣ PHATE与细胞通讯分析：利用PHATE进行可视化展示，通过CellChat、CellPhoneDB分析细胞间的通讯关系。 9️⃣ 拟时间分析与SCENIC分析：利用Monocle2、Monocle3进行拟时间分析，通过SCENIC分析预测基因调控网络。 𐟔Ÿ RNA动力学与联合分析：研究RNA的动力学变化，结合VDJ、空间转录组、scATAC-seq等数据进行联合分析，全面理解细胞的转录组变化。通过这一系列的分析步骤，可以深入挖掘单细胞转录组数据中的生物学信息，为生物学研究提供有力的支持。

单细胞数据分析，一文搞定！单细胞数据分析是一个充满挑战和发现的领域，涵盖了从基因组学到细胞通讯的多个方面。以下是一些关键的分析步骤和方法，帮助你深入探索单细胞数据：样本质控/降维/聚类/双细胞去除 𐟧ꊥ䚦 𗦜즕𔥐ˆ（Harmony） 𐟌 细胞亚群注释 𐟓š NNLS样本亚群迁移 𐟌 Augur：基于随机森林判定细胞亚群转录组扰动 𐟌𓊍agellan：基于随机森林判定空转区域最大扰动（空间转录组） 𐟌Œ 亚群细分（提取感兴趣亚群重新聚类） 𐟔 各细胞类型占比 𐟓Š 差异基因计算及可视化 𐟎芍arker基因计算及可视化（气泡图/热图/小提琴图/UMAP或TSNE基因表达展示） 𐟌Ÿ 功能富集分析 𐟔슇SVA分析 𐟓ˆ 细胞亚群GO/KEGG分析 𐟓Š 通路差异得分计算 𐟓Š AUCell通路活性打分 𐟌€ PHATE 𐟌🊧𛆨ƒž通讯分析 𐟓ኃellChat细胞通讯推断 𐟔 CellPhoneDB细胞通讯分析 𐟓𖊦‹Ÿ时间分析 ⏳ Monocle2 ⏳ Monocle3 ⏳ inferCNV、copycat 𐟧슓CENIC分析 𐟌 非负矩阵分解NMF 𐟧銒NA动力学 ⚡ 转录组与VDJ联合分析 𐟧슧麩—𔨽쥽•组联合分析 𐟌 scATAC-seq联合分析 𐟧슊这些工具和方法可以帮助你从单细胞测序数据中提取有价值的生物学信息，进一步了解细胞的复杂性和多样性。无论是单细胞个性化分析、转录组研究还是空间转录组分析，这些技术都能为你提供深入的见解。

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