merip前沿信息_merip-seq全称(2024年12月实时热点)
m6A MeRIP试剂盒,让RNA甲基化研究更加高效准确!
MeRIP实验详解,一文搞定! 探索RNA修饰的奥秘,MeRIP实验是关键。 这里为你提供MeRIP实验的详细步骤,助你一臂之力! 1️⃣ 准备RNA:首先,提取总RNA,并分出5-10ul作为Input。 2️⃣ 结合抗体:将40ug RNA与RIP buffer(包含10mM Tris HCl、150mM NaCL和0.1% NP-40)混合,加入1ug抗体/ IgG和RNase Inhibitor(推荐比例为1:500)。在4度摇床中过夜。 3️⃣ 清洗Protein A/G beads:用10倍体积的RIP buffer清洗beads,每次4度、1000rpm、1分钟,重复3次。 4️⃣ 结合RNA-抗体复合物:将步骤1中的混合液体加入到步骤2清洗好的beads中,加入RNase Inhibitor,继续在4度摇床中摇动4小时。 5️⃣ 清洗beads:离心后,用1ml RIP buffer洗去非特异性结合,重复3-5次。 6️⃣ 洗脱RNA:加入500ul Trizol震荡混匀,4度摇床10分钟。然后加入100ul氯仿,冰上放置5分钟,离心后取上层水相。 7️⃣ 沉淀RNA:将上层水相转移至新的RNase free的1.5EP管中,加入2ul糖原和等体积异丙醇,放置于-20度过夜。 8️⃣ 离心沉淀:4度离心,15000g,10分钟。去上清,加入1ml 75%乙醇颠倒混匀。 9️⃣ 再次离心:4度离心,7500g,5分钟。去上清。 干燥与溶解:室温晾干后,加入适量DEPC水(推荐20ul)溶解。测量浓度,进行后续RT-PCR。 1️⃣1️⃣ RT-PCR:逆转录时,逆转的量与Input相同。 1️⃣2️⃣ 结果分析:计算t=CT RIP-CT Input,表达量=2^(-t)。 通过这些步骤,你可以深入探索RNA修饰的奥秘。
RIP和MeRIP实验全攻略:步骤详解 RIP和MeRIP是两种不同的实验方法,各有各的目的。RIP实验的目的是验证蛋白质和RNA的结合情况,而MeRIP则是为了研究特定基因上的修饰。两者的操作步骤也略有不同,但都需要在低温条件下进行,并添加RNase Inhibitor和蛋白酶抑制剂。 RIP实验步骤: 准备工作:将细胞放在冰上,加入1ml RIP buffer(含有25 mM Tris, pH 7.4, 150 mM KCl, 0.5 mM DTT, 0.5% NP-40),并加入蛋白酶抑制剂和RNase Inhibitor。在冰上裂解20分钟。 收集细胞:将细胞收集到1.5ml的EP管中,4度下15分钟,12000g离心,取上清液到新的EP管中。取适量总蛋白作为Input,用于后续的WB检测。 抗体孵育:将剩余的上清液与目的蛋白抗体混合,4度下孵育过夜。 清洗Beads:用10倍体积的NT2 buffer(含有50 mM Tris, pH 7.4, 150 mM NaCl, 1 mM MgCl2, 0.05% NP-40)清洗Protein A/G beads,4度下1000rpm离心1分钟,重复3次。将步骤2中得到的蛋白-抗体复合物加到预清洗好的beads中,并加入RNase Inhibitor。4度下摇床4小时。 清洗Beads:用1ml NT2 buffer清洗beads,4度下1000rpm离心1分钟,重复3-5次。最后一次洗beads时,取出适量beads,加2xloading buffer煮沸,进行WB检测。 提取RNA:加500ul Trizol震荡混匀,4度下摇床10分钟。加入100ul氯仿,震荡混匀,冰上5分钟。4度下15000g离心15分钟。 分离RNA:取上层水相于新的RNase free的1.5EP管中,加入2ul糖原混匀,再加入等体积异丙醇,-20度过夜。4度下15000g离心10分钟,去上清,加入1ml 75%乙醇颠倒混匀。4度下7500g离心5分钟,去上清。室温晾干后,加入20ul DEPC水溶解,测溶度后进行后续qRT-PCR检测。 MeRIP实验步骤: 提取总RNA:首先提取细胞中的总RNA。 抗体拉RNA:用修饰抗体拉取特定RNA。 清洗Beads:用NT2 buffer清洗beads,并进行后续操作。 提取RNA:提取beads上的RNA,并进行测序或qRT-PCR验证。 这两种实验方法都需要在低温条件下进行,并添加RNase Inhibitor和蛋白酶抑制剂,以确保实验结果的准确性。
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